Многие животные заповедника имеют ограниченное распространение.
Здесь живут две семьи оленей, два Кавказских диких кота.
А еще серна, рысь, волки, кабаны, шакалы.
Отдельно стоит отметить ныне практически истреблённого горного зубра – самое большое и древнее животное Кавказа.